感染愛滋病病毒大約兩至四個禮拜後，身體會因為對病毒作出反應而出現一些病徵。有些感染者有類似流感嘅病徵（通常被稱為「大感冒」），症狀包括發燒、疲倦、喉嚨痛、皮疹、腹瀉和淋巴腫脹，並可以持續幾日至幾個禮拜。
在這個期間（空窗期），感染可能仲未喺愛滋病病毒抗體測試顯示出來，但感染者已經可以把病毒傳染畀其他人，而且傳染性很強。出現這些病徵，亦都唔應該假定自己已經感染愛滋病，原因係這些病徵可以由其他疾病所引起，所以必須請教醫生，並接受愛滋病測試。
這個階段係不會出現任何病徵，而且可以維持十年左右。但病毒仍活躍，繼續複製及破壞更多CD4淋巴細胞，感染者依然可以在這個階段把愛滋病病毒傳畀其他人。如無接受抗病毒治療，免疫系統會受到嚴重受損。
如果你感染咗愛滋病病毒，但係無接受治療，病毒最終會損害身體嘅免疫系統。當免疫系統嚴重受損，患者容易受到一啲通常對健康嘅人不會致病嘅病菌和病毒感染，併發某些惡性腫瘤同機會性感染。機會性感染係一些在人類免疫能力下跌時乘虛而入嘅感染，發生這種情況時，感染已經進入發病期，亦就係人所共知嘅愛滋病。如沒有接受治療，平均五成的愛滋病病毒感染者會在十年內演變成愛滋病人。
